日本石龟可以活25年左右，日本石龟的体色基本上是棕色的，是一种很擅长游泳的乌龟，它们主要是在小河、沼泽或者是池塘中活动，一般是在池塘的底部冬眠。人工饲养日本石龟需要注意的是，刚带回家的乌龟好是经过消毒再放入池中混养，野生的日本石龟可以通过暴晒消毒。日本石龟是倾向于肉食类的乌龟，可以给它们喂食水中昆虫或者是水生植物。
日本石龟整体基本上都是棕色的，而头部颜色会稍浅一些，两侧和颌部上长有深色的斑点。可能有一条棱突，其上也许会有一条浅色的条纹，但也许没有。后缘呈明显的锯齿状。背甲上可能具有清晰的特征性的年轮，还可能会有由放射状的细沟构成的精致纹样。腹甲上有一个缺刻。
一些较大的雌龟，其背甲的直线长度可达7，但大多数往往都要小一些，5-6。成体的背甲长度为13-18cm。日本石龟的体色呈棕色，略略带点黄。其头部是橄榄棕色的。背部有一条不太明显的脊棱。背甲的后缘呈锯齿状。四肢和尾部的边缘长有橙色或暗橙色的条纹。雌龟比雄龟来得大。而雄龟则有个长尾巴。
